Bu operasyonda, midenin büyük kısmı ve duodenum (12 parmak bağırsağı) devre dışı bırakılır, küçük hacimli bir mide bölümü bağırsaklara bağlanır. Hem tüketilen gıda miktarının azalması, hem de alınan gıdanın emiliminin az olması hedeflenir.
Laparoskopik (kapalı) olarak yapılan gastrik bypass ameliyatı karın cildine açılan 5-6 adet küçük delikten özel aletlerle gerçekleştirilir. Ortalama 2 saat sürer. Hastalar ameliyat bittikten 3-4 saat sonra ayağa kalkabilir hale gelir. 3-5 gün sonra taburcu edilebilir.